Animirani film temelji na Nintendovi franšizi video iger Mario. Vodovodar po imenu Mario s svojim bratom Luigijem potuje skozi podzemni labirint in poskuša rešiti ujeto princeso.
Po več letih zavetja pred človeškim svetom so se bratje želve odločili, da z junaškimi dejanji osvojijo srca Newyorčanov ter da so sprejeti kot povsem normalni najstniki. Njihova nova prijateljica April O'Neil jim pomaga prevzeti skrivnostno zločinsko združbo, vendar jim gre kmalu čez...
Ko se pojavi nova grožnja, morajo jezni ptiči in zeleni pujsi pozabiti na stare zamere ter združiti moči zoper skupnega sovražnika. Tako sklenejo krhko zavezništvo in ustanovijo supermoštvo, da bi rešili svoje domove.
